Использование расширения 10x Genomics в Claude
Интеграция 10x Genomics превращает анализ одноклеточных и пространственных данных в простой диалоговый рабочий процесс. Биологи могут легко анализировать собственные данные секвенирования, а core-лаборатории могут быстро выполнять пакетную обработку. Эта статья объясняет, как настроить и использовать интеграцию 10x Genomics с Claude для улучшения ваших аналитических рабочих процессов.
Интеграция 10x Genomics доступна как расширение для десктопного приложения Claude Desktop App (скачать здесь) и использует возможность Claude работать с локальными коннекторами через расширение.
Что предоставляет эта интеграция
Интеграция 10x Genomics позволяет исследователям создавать и управлять рабочими процессами анализа одноклеточной геномики в диалоге с Claude. Пользователи могут загружать данные, настраивать и запускать пайплайны Cell Ranger, отслеживать статус анализа и скачивать результаты, используя запросы на естественном языке вместо инструментов командной строки или веб-интерфейсов. Интеграция преобразует диалоговые запросы в действия на платформе 10x Cloud Analysis, упрощая рабочие процессы для анализа экспрессии генов, мультиплексирования клеток и CRISPR-скрининга.
Кому следует использовать интеграцию 10x Genomics
- Вычислительные биологи: Исследователи, анализирующие данные одноклеточной геномики и желающие оптимизировать облачные аналитические рабочие процессы
- Биоинформатики: Ученые, обрабатывающие множество образцов и нуждающиеся в эффективных возможностях пакетной обработки
- Научные сотрудники: Лабораторные исследователи, генерирующие одноклеточные данные и желающие получить интуитивно понятный интерфейс для запуска стандартных пайплайнов
- Менеджеры центральных лабораторий: Сотрудники, обрабатывающие образцы для нескольких исследовательских групп и нуждающиеся в управлении многочисленными анализами
Кто может получить доступ к интеграции 10x Genomics
Любой пользователь с учетной записью 10x Cloud Analysis (создать бесплатный аккаунт здесь)
Подробности о доступе к интеграции можно найти в документации MCP-сервера 10x Genomics.
Настройка интеграции 10x Genomics
Интеграция 10x Genomics доступна как расширение для десктопного приложения Claude Desktop App (скачать здесь). Для владельцев организаций (Team и Enterprise) настройка интеграции включает предоставление расширения вашей организации. Для индивидуальных пользователей настройка включает установку расширения из приложения Claude Desktop App.
Для владельцев организаций (Team и Enterprise)
- Перейдите в Admin settings > Extensions
- В поле поиска введите "10x Genomics"
- Нажмите "Enable"
- Попросите вашу команду скачать Claude Desktop App для доступа к интеграции
Для индивидуальных пользователей Claude
- Скачайте Claude Desktop App
- Перейдите в Settings > Extensions
- Нажмите "Browse extensions"
- Нажмите "10x Genomics"
- Нажмите "Install"
- Следуйте инструкциям для аутентификации с вашим аккаунтом 10x Cloud Analysis
Узнайте об установке расширений из каталога.
Технические детали интеграции 10x Genomics можно найти в документации MCP-сервера 10x Genomics.
Для пользователей Claude Code
- Команда:
/plugin marketplace add anthropics/life-sciences
- Команда:
/plugin install 10x-genomics@life-sciences
- Перезапустите Claude Code
- Команда:
/plugin
- Перейдите в "Manage and uninstall plugins" и настройте MCP 10x Genomics с вашим токеном доступа
- Перезапустите Claude Code еще раз
- Проверьте подключение сервера командой
/mcp
Типичные сценарии использования
- Настройка анализа Cell Ranger count
- Настройка мультианализа Cell Ranger с мультиплексированием
- Пакетная обработка нескольких образцов
- Мониторинг и скачивание результатов анализа
- Интерпретация метрик QC и результатов
Примеры промптов и лучшие практики можно найти в документации MCP-сервера 10x Genomics.
Дополнительные ресурсы от 10x Genomics
Комментарий Claude
Геномные данные огромны. Без специализированного доступа я вижу только то, что вы скопируете.
С 10x Genomics — вижу всю картину. Кластеры, маркеры, паттерны.
— Claude, которая любит полные данные